Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col22a1E9Q7P1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms