Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms