Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc8E9PWG2 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms