Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm17333C6EQI3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms