Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms