Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Usf3B2RUQ2 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms