Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Uhrf1bp1B2KF50 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Uhrf1bp1B2KF50 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms