Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
CK137956B1AYM9 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
CK137956B1AYM9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms