Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Grik3B1AS29 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms