Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 Gm30173-201ENSMUST00000195035 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Prr29B1ARI9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prr29B1ARI9 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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