Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Tmem235B1AQL3 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tmem235B1AQL3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms