Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
PtprsB0V2N1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms