Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf39A2RT81 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rnf39A2RT81 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Rnf39A2RT81 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rnf39A2RT81 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms