Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SetxA2AKX3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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