Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Lcn6A2AJB9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Lcn6A2AJB9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lcn6A2AJB9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms