Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

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Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ube2dnl2A2AFH2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ube2dnl2A2AFH2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms