Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

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Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Prdm16A2A935 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Prdm16A2A935 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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