Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Pramef6A2A8M8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms