Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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