Protein–RNA interactions for Protein: S4R2K0

Pdf, Peptide deformylase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdfS4R2K0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PdfS4R2K0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PdfS4R2K0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms