Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2K1

Krt16, Keratin, type I cytoskeletal 16, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt16Q9Z2K1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt16Q9Z2K1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt16Q9Z2K1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Krt16Q9Z2K1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms