Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nek4Q9Z1J2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nek4Q9Z1J2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nek4Q9Z1J2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.2 ms