Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hmg20bQ9Z104 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hmg20bQ9Z104 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hmg20bQ9Z104 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms