Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Clcn5Q9WVD4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Clcn5Q9WVD4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clcn5Q9WVD4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms