Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vax2Q9WTP9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vax2Q9WTP9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms