Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mpdu1Q9R0Q9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mpdu1Q9R0Q9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms