Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tk2Q9R088 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tk2Q9R088 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tk2Q9R088 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms