Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXY9

Pex3, Peroxisomal biogenesis factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex3Q9QXY9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex3Q9QXY9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex3Q9QXY9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex3Q9QXY9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex3Q9QXY9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pex3Q9QXY9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pex3Q9QXY9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pex3Q9QXY9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pex3Q9QXY9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pex3Q9QXY9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pex3Q9QXY9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms