Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg2Q9QXK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Copg2Q9QXK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 429.4 ms