Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV1

H2-Oa, H2-O alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-OaQ9QWV1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-OaQ9QWV1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-OaQ9QWV1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-OaQ9QWV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-OaQ9QWV1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-OaQ9QWV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H2-OaQ9QWV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2-OaQ9QWV1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2-OaQ9QWV1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-OaQ9QWV1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2-OaQ9QWV1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms