Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PolkQ9QUG2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PolkQ9QUG2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PolkQ9QUG2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms