Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prg3Q9JL95 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prg3Q9JL95 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prg3Q9JL95 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms