Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gde1Q9JL56 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gde1Q9JL56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gde1Q9JL56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms