Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bace2Q9JL18 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bace2Q9JL18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bace2Q9JL18 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms