Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Trem3Q9JKE1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Trem3Q9JKE1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trem3Q9JKE1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms