Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Copb1Q9JIF7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms