Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Copz2Q9JHH9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Copz2Q9JHH9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms