Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ropn1Q9ESG2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ropn1Q9ESG2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ropn1Q9ESG2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms