Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cmtm7Q9ESD6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cmtm7Q9ESD6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cmtm7Q9ESD6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms