Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Dap3Q9ER88 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Dap3Q9ER88 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dap3Q9ER88 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms