Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
MNCb-2875Q9DCB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MNCb-2875Q9DCB3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MNCb-2875Q9DCB3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms