Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smg9Q9DB90 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smg9Q9DB90 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smg9Q9DB90 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smg9Q9DB90 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms