Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc1Q9DB70 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Fundc1Q9DB70 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc1Q9DB70 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms