Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmtm2aQ9DAR1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmtm2aQ9DAR1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cmtm2aQ9DAR1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms