Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Actrt1Q9D9J3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Actrt1Q9D9J3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Actrt1Q9D9J3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms