Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Hcfc2Q9D968 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hcfc2Q9D968 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms