Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Srp19Q9D7A6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Srp19Q9D7A6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Srp19Q9D7A6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Srp19Q9D7A6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Srp19Q9D7A6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Srp19Q9D7A6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Srp19Q9D7A6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Srp19Q9D7A6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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