Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D727 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D727 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D727 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9D727 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9D727 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9D727 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9D727 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D727 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D727 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q9D727 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D727 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D727 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D727 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q9D727 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D727 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q9D727 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms