Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc81Q9D5W4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc81Q9D5W4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc81Q9D5W4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc81Q9D5W4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms