Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Speer4f1Q9D5Q6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Speer4f1Q9D5Q6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms